Как упомянуто выше, полагают, что реактивный артрит частично является генетическим заболеванием. Существуют определенные генетические маркеры, которые значительно чаще встречаются среди пациентов с реактивным артритом, чем в популяции. Например, HLA-B27 ген обычно обнаруживается у пациентов с реактивным артритом. Даже у тех пациентов, которые имеют генетическую основу, которая предрасполагает к развитию реактивного артрита, тем не менее, похоже, что для запуска заболевания требуется воздействие определенных инфекций. Реактивный артрит может возникать после венерических инфекций. Наиболее распространенная инфекция, которая связывается с пост-венерической формой реактивного артрита в организме, хламидиоз. Реактивный артрит также может возникать после инфекций кишечника, вызываемых такими бактериями, как сальмонелла, шигелла, иерсиния и кампиллобактер. В типичных случаях, артрит развивается 1 - 3 недели спустя начала бактериальной инфекции.